Un sitio web como el que te planteas es es algo complicado... hablamos por como te expresas tus conocimientos de php son algo limitados, es como que si en tu primer semestre de la universidad quizas hacer una tesis para un doctorado... hay que estudiar mas y no solo cuestion de ver unos videos y listo.. son muchas horas de aprendizaje y practicas, correcciones y errores...

Tutoriales hay miles de millones... particularmente te recomiendo aprender primero PHP:

http://www.phpya.com.ar/

Luego introducirte al mundo PHP orientado a Objetos..

http://www.phpya.com.ar/poo/

Leer y buscar de todo en internet sobre php, tecnicas y demas... (siempre pensando en POO)

Luego busca un framework para que te ayude a hacer tu trabajo, en el mercado hay miles... particularmente recomiendo 3

Symfony Para mi sin lugara duda el framework a elejir, una comunidad muy amplia mucha documentacion en español (asi como en otros idiomas) la opcion mas completa desde mi particular punto de vista.

Kumbia Proyecto latinoamericano muy interesante, uno de sus desarrolladores principales pertenece a la comunidad y te pueden ayudar facilmente...

Kohana Otro proyecto muy bueno, una comunidad bastante activa y esto es muy bueno... proyecto bastate completo y rapido... Aunque admito que soy mas adicto es de su filosofia..


En caso de que no quieras darte tanto kilombo con todo esto que te estoy dando... busca por internet algun CMS de e-commerce y esto te ahorraria mucho trabajo, aunque son soluciones temporales a mi parecer...

Hola Amigos!
Muchas gracias por sus respuestas y por las sugerencias que me hacen!
Entiendo que llegar a desarrollar un sitio como el que menciono es algo realmente complicado y grande, producto de mucho estudio, analisis y desarrollo. Entiendo que sería como querer hacer el Doctorado apenas comenzando la universidad, pero como en todo hay pasos que al seguirlos uno tras otro llevan a resultados. No pretendo aprenderlo con unas pocas horas de ver videos por internet o leer pocas hojas, quiero aprender realmente el funcionamiento de una tienda como esta, ya que siento curiosidad y dispongo del tiempo para aprenderlo.
Preguntaba si sabian de algún libro o material, pues he visto algunos libros de Anaya de unas 300 páginas que explican detalladamente cada paso a seguir, y al final se desarrolla un proyecto de determinada complejidad, lamentablemente no he dado con algún libro sobre este tema, me refiero a desarrollar una tienda virtual con las caracteristicas de www.mercadolibre.com.
Imagino que en esta se integran diferentes conocimientos, pues a veces un proyecto depende de la integración de muchos.
 Apenas estoy aprendiendo, pero tengo la disposición para aprender todo lo necesario! 
 Voy a revisar todas las recomendaciones que me han dado para ir entendiendo de qué se tratan.
 Estaré por acá, gracias y saludos a todos!